Фамилия Бражененко — характерный пример украинской фамилии, образованной по модели с суффиксом -енко. Этот суффикс, один из самых распространённых в украинской ономастике, изначально означал «сын» или «потомок»: Бражененко — буквально «сын Бражена» или «потомок Браженого». Основа фамилии восходит к прозвищу Браженый, которое, в свою очередь, связано со словом «брага» — старинным хмельным напитком из солода и хмеля.

Прозвище Браженый могли дать человеку по нескольким причинам. Самая вероятная — профессиональная: предок мог быть бражником, то есть человеком, который варил брагу, торговал ею или держал питейное заведение. В XVII–XVIII веках на Украине бражниками называли шинкарей и владельцев корчем, что было распространённым ремеслом. Менее вероятно, но тоже возможно, что прозвище закрепилось за любителем выпить — «бражником» в бытовом смысле, хотя для постоянного прозвища такая причина менее типична, чем занятие.

С географической точки зрения фамилия Бражененко тяготеет к центральным и восточным областям Украины — Полтавщине, Черкащине, Сумщине, где суффикс -енко особенно характерен. Встречается она и в приграничных районах России, куда попала с переселенцами. Интересно, что у фамилии есть «двойник» — Бражник, тоже украинская, но образованная без патронимического суффикса, напрямую от названия профессии. Бражененко же — более поздняя форма, подчёркивающая принадлежность к роду конкретного Бражена.

Сословно носители фамилии относились в основном к казачеству и крестьянству. Украинские фамилии на -енко в массе своей закрепились в реестрах Войска Запорожского и среди сельского населения. Дворянских корней у Бражененко, скорее всего, нет — это «народная» фамилия, возникшая в среде, где человека называли по занятию отца или его прозвищу.