Фамилия Бубенин образована от личного прозвища и относится к распространенному типу русских фамилий. Прозвище Бубен давали в старину, во-первых, мастеру, делающему ударный музыкальный инструмент бубен; во-вторых, человеку, который беспрестанно болтает или неразборчиво бубнит; в-третьих, промотавшемуся, разорившемуся бедолаге. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Бубен, со временем получил фамилию Бубенин. О точном месте и времени возникновения фамилии Бубенин в настоящее время говорить сложно, поскольку процесс формирования фамилий был достаточно длительным. Тем не менее, фамилия Бубенин представляет собой замечательный памятник славянской письменности и культуры.