Фамилия Будишовская — редкий пример, где географическая привязка почти наверняка перевешивает прозвищную версию. Типичный суффикс -ск- указывает на дворянское или польско-шляхетское происхождение, но в данном случае это скорее всего не сословный маркер, а чисто топонимический: такую фамилию получал человек, владевший или живший в местечке Будишов (или Будишево). Сама основа «Будиш» — это, скорее всего, не имя, а название населённого пункта, образованное от личного имени Буд или Будко (уменьшительное от Будимир, Будислав). В польской и западноукраинской ономастике суффикс -ов-ск-ий типичен для фамилий, произведённых от названий сёл: Будишов → Будишовский.

Менее вероятная, но возможная версия — что основа восходит к глаголу «будить». В этом случае прозвище Будиш мог получить человек, который рано вставал или будил других на работу. Однако суффикс -ск- для прозвищных фамилий нехарактерен: он прирастал к основе обычно тогда, когда прозвище уже превратилось в название поместья. Поэтому правдоподобнее считать, что предок носителя фамилии либо владел землёй в Будишове, либо был выходцем оттуда.

Фамилия встречается в основном на западе Украины (Волынь, Подолье) и в Польше, где фиксируется форма Budziszowski. В русском написании через «о» (Будишовская, а не Будишевская) — это след польской орфографии: в польском языке суффикс -ów- передаёт твёрдое «у». С точки зрения словообразования, фамилия женская, мужской вариант — Будишовский. Из-за редкости фамилии точных данных о сословной принадлежности предков нет, но географический суффикс и польский след намекают, что носители могли быть либо мелкой шляхтой, либо крестьянами, взявшими фамилию по названию родного села.