Фамилия Будишко — яркий пример того, как по суффиксу можно определить географию предков. Формант -ко характерен для украинской, белорусской и южнорусской ономастики. В этих регионах суффикс часто выполнял уменьшительную или пренебрежительную функцию, но в фамилиях он закрепился как патронимический — указывал на родство: Будишко, скорее всего, «сын (или потомок) Буды» или «маленький Буда».

Основа фамилии — Буда — многозначна. Самое распространённое объяснение: прозвище от глагола «будить». Так могли назвать человека, который рано вставал и поднимал всех вокруг, или, в переносном смысле, — задиру, возмутителя спокойствия. В славянских говорах «буда» также означала «строение, будка, временное жильё». Тогда прозвище могло достаться строителю таких сооружений или человеку, жившему в отдалённой сторожке.

Менее вероятная, но возможная версия — от личного имени Будислав или Будимир. В древнерусской традиции такие двусоставные имена (с корнем «буд-» — «бодрствовать, заботиться») были распространены, а их сокращённая форма Буда могла стать самостоятельным именем. Однако фамилии на -шко чаще образуются именно от прозвищ, а не от полных имён.

Встречаемость фамилии невысока, что говорит о её локальном происхождении. Основной ареал — западные области Украины (Волынь, Подолье) и юг Беларуси (Брестская, Гомельская области). В России фамилия редка и встречается в основном в регионах, куда переселялись крестьяне с запада империи — например, на Кубани или в Сибири.

По социальному составу носители Будишко в XIX веке — преимущественно крестьяне и мещане. Фамилия не попала в дворянские родословные книги, что подтверждает её «низовое» происхождение от прозвища или уличного имени. В отличие от фамилий на -ов/-ев, которые в этой среде были редкостью, модель на -ко оставалась типичной для простого люда украинских и белорусских губерний.