Фамилия Букатар — редкая и неочевидная с точки зрения происхождения. Сразу бросается в глаза её нетипичный для русских фамилий суффикс -ар. В русской модели фамильных суффиксов он встречается редко и чаще указывает на заимствование из тюркских или балканских языков, либо на профессиональное прозвище по роду деятельности.

Наиболее вероятная версия связывает основу «букат-» с тюркским словом «бука» — бык, самец крупного рогатого скота. В таком случае суффикс -ар (или -чи в других вариантах) мог означать человека, который пасёт быков, ухаживает за ними или торгует ими. Параллели есть в фамилиях типа Букетов (от «букет» — бычок в некоторых тюркских наречиях) или Букаров. Однако Букатар — форма более архаичная, возможно, восходящая к прозвищу «Букатар» — пастух-бычатник.

Вторая версия, менее распространённая, но имеющая право на существование, — связь с диалектным русским словом «букат» или «букатый» (от «бука» — хмурый, нелюдимый человек). Тогда прозвище Букатар могли дать человеку угрюмого, замкнутого нрава. Суффикс -ар в этом случае мог играть усилительную роль («тот, кто бука»), либо это результат переосмысления более старой формы.

Географически фамилия Букатар встречается в основном в южных регионах России и на Украине, что подтверждает тюркскую версию: именно в этих местах был силён контакт с тюркскими народами (ногайцы, крымские татары). Также единичные носители есть в Болгарии и Молдавии, где суффикс -ар в фамилиях встречается чаще (ср. болгарские фамилии на -ар: Риба́р, Овча́р).

В документах XVII–XVIII веков фамилия не зафиксирована, что говорит о её позднем оформлении. Скорее всего, она возникла не как родовая, а как уличное прозвище, которое закрепилось за семьёй уже в XIX веке при переписях.

Таким образом, предок носителя фамилии Букатар с высокой вероятностью был скотоводом, пастухом или торговцем скотом, либо получил прозвище за свой «буковатый» характер. Второй вариант правдоподобен, но уступает первому по частоте встречаемости в ономастике юга России.