Фамилия Бурнезоп — редкая и неочевидная по своему составу. Она почти наверняка искусственного происхождения, то есть не образовалась естественным путём от прозвища или профессии, а была придумана или изменена в канцелярии. В ней слышится иноязычный, скорее всего французский или немецкий, корень — «бурн» (от фр. borne — граница, межа, или от нем. Burn — ручей, источник), и русский суффикс -ов, который обычно указывает на принадлежность («чей?»). Но здесь он стоит не на месте: в типичной русской фамилии суффикс присоединяется к основе, а «-зоп» — тёмный элемент, не похожий ни на одно славянское слово.

Самая вероятная версия: фамилия возникла в семинарской среде. В XIX веке будущим священникам нередко давали благозвучные фамилии из латинских или греческих корней, а иногда переделывали русские на иностранный манер. «Бурнезоп» могло быть калькой или переделкой: например, от лат. burnus (красноватый) или от фамилии Бурназов (от тюркского «бурназ» — гордый, несговорчивый), которую «украсили» окончанием -оп, чтобы звучало солиднее. Встречается также гипотеза, что это вариант фамилии Бурнашев (от диалектного «бурнаш» — беспокойный человек), но тогда непонятно, откуда взялось «-зоп».

Географически фамилия почти не встречается за пределами бывшей Российской империи. В современных базах данных носители Бурнезоп единичны и сосредоточены в центральной России и на Украине. Это подтверждает версию об искусственном, а не родовом происхождении: фамилию могли записать при крещении или при получении паспорта в одном-двух уездах, и она не успела распространиться.

Таким образом, предок с фамилией Бурнезоп, скорее всего, был либо выходцем из духовного сословия (семинаристом, получившим «книжную» фамилию), либо человеком, чью настоящую фамилию (вроде Бурнакова или Бурцева) приказным порядком изменили, придав ей необычную форму. Точное значение корня остаётся спорным, но ясно, что перед нами не крестьянское прозвище, а кабинетное изобретение.