Фамилия Бушмаков образована по стандартной русской патронимической модели с суффиксом -ов, который в данном случае указывает на происхождение от отца: «чей?» — Бушмаков, то есть сын Бушмака. Основа фамилии — прозвище или некалендарное имя Бушмак.

Корень «буш» в русских говорах имеет несколько значений. В северных и сибирских диалектах «бушма» или «бушмак» — это старый, изношенный лапоть, а также неряха, неопрятный человек. Однако в южнорусских говорах, особенно на Дону и Кубани, слово «бушма» означало «чурбан», «обрубок дерева», а «бушмак» — нечто неуклюжее или неповоротливое. Таким образом, прозвище Бушмак могли дать человеку либо за небрежность в одежде, либо за медлительность и тяжеловесность.

Менее популярная, но лингвистически возможная версия связывает фамилию с тюркским корнем. В татарском и башкирском языках «буш» означает «пустой», «свободный», а «мак» — аффикс, образующий существительные. В этом случае Бушмак могло быть прозвищем человека, живущего в одиночестве, холостяка или бедняка. Однако для русской фамилии эта версия менее вероятна: суффикс -ов и общая география бытования (преимущественно центральные и южные области России) указывают на исконно славянскую основу.

В документах XV–XVII веков фамилия не фиксируется, что говорит о её относительно позднем оформлении — скорее всего, в XVIII–XIX веках, когда крестьяне и мещане массово получали фамилии. Носители фамилии Бушмаковы встречаются в Тамбовской, Рязанской и Воронежской губерниях, что косвенно подтверждает диалектную версию происхождения от «бушмы» — лаптя.

Стоит обратить внимание на то, что фамилия не имеет дворянских вариантов с суффиксом -ский или -ской, что указывает на её крестьянское или мещанское происхождение. Среди однокоренных фамилий — Бушма, Бушмин, Бушманов — Бушмаков выделяется именно суффиксом -ак, который в русской ономастике часто придавал прозвищу оттенок пренебрежения или уменьшительности.