Фамилия Бутовкий чаще всего встречается в украинском и польском ареалах, и её написание с окончанием на -кий указывает на характерную для этих регионов модель образования. В отличие от великорусских фамилий на -ов/-ев или -ин, суффикс -ский (-цкий) в восточнославянской традиции обычно означал либо принадлежность к географическому объекту (селу, урочищу), либо связь с прозвищем или профессией через притяжательное значение «относящийся к…». В данном случае основа «Бутов-» восходит к имени или прозвищу Бут, Бутко.

Самая прямая версия — происхождение от топонима. В Польше, на западе Украины и в Беларуси есть несколько населённых пунктов с названием Бутово, Бутов, Бутовка. Человек, переселившийся оттуда, получал прозвище «Бутовский» — «тот, кто из Бутова». Это типичная «дворянская» модель фамилий, но на деле её носили не только шляхтичи: в XVIII–XIX веках так оформляли фамилии и крестьянам при переписях, особенно в западных губерниях Российской империи.

Вторая версия, не менее вероятная, — от личного имени Бутко. Это уменьшительная форма от славянских имён Будемир, Будислав или, реже, от крестильного Вукол (через народное Бут). Суффикс -ко в украинской и белорусской среде был распространённым патронимическим показателем («сын Бута»). От Бутко с помощью топонимического суффикса -ский и образовали фамилию Бутовкий. Такая двойная модель — от имени через прозвище — встречается, например, в фамилиях Ковальский, Гончарский.

Стоит отметить редкое написание через «о» в корне (Бутов-), а не через «а» (Бутав-), что указывает на устойчивую орфографию, закреплённую в документах. Сама фамилия не очень частая, но её носители концентрируются в исторических регионах Волыни, Подолья и Галичины. В дворянских родословных книгах фамилия Бутовский (через «с») встречается, но вариант с «твёрдым» окончанием «-кий» характерен для простонародной или поздней канцелярской записи, где смешивались суффиксы.