Фамилия Бутысин, как и многие русские фамилии, хранит в себе память о прозвище, которое носил её родоначальник. В основе фамилии лежит прозвище Бутыся. Его происхождение связано с глаголом «бутыскать», что означало «бодать, пырять», а также «бычиться, глядеть угрюмо, исподлобья». Если отталкиваться от этого значения, то прозвище Бутыся могло характеризовать человека угрюмого, нелюдимого, молчаливого — того, кто смотрит на мир исподлобья.

Существует и другое объяснение, которое не противоречит первому, а скорее дополняет его. Прозвище Бутыся могли дать и от слова «бутус». В старину бутусом называли приземистого, коренастого, плотного человека. В новгородских и пермских говорах это слово имело дополнительный оттенок: так говорили об упрямце или угрюмом человеке. Получается, что прозвище Бутыся могло указывать либо на особенности внешности — невысокий, крепко сбитый мужчина, либо на характер — упрямый и неразговорчивый.

Модель образования фамилии проста и прозрачна: к основе Бутыс- добавился типичный русский суффикс принадлежности -ин, отвечающий на вопрос «чей?». Бутысин — значит «сын Бутыси» или «потомок Бутыси». Такая модель широко распространена в северных и центральных областях России, где фамилии на -ин составляют значительную часть.

Первые документальные свидетельства об однокоренных фамилиях относятся к XVII веку. Известен, например, устюжский дьячок Яков Бутусов, упомянутый в 1660 году. Эта запись важна: она показывает, что прозвище и фамилия бытовали на Русском Севере, в районе Великого Устюга. Хотя фамилия Бутусов и Бутысин различаются конечным суффиксом, их общий корень и географическая привязка позволяют предположить, что род Бутысиных мог сформироваться именно в тех краях.

Фамилия Бутысин — редкий пример, когда прозвище, скорее всего, не было связано с профессией или местом жительства, а целиком описывало человека. При этом грань между «внешним» и «внутренним» значением размыта: коренастый человек мог быть и угрюмым, а угрюмый — коренастым. Определить, какое из значений стало первичным для конкретного предка, можно только в ходе генеалогического поиска.