Фамилия Бутысина — один из тех случаев, где за основу взято не крестильное имя, а прозвище. В центре внимания здесь не святой покровитель, а личная черта или внешность человека, который жил несколько веков назад. Прозвище Бутыся, от которого образована фамилия, скорее всего, связано с глаголом «бутыскать» — «бодать, пырять», а также «бычиться, глядеть угрюмо, исподлобья». Если следовать этой версии, родоначальник Бутысиных был человеком угрюмым и молчаливым, с тяжёлым взглядом.

Есть и вторая, не менее правдоподобная гипотеза. Она отталкивается от слова «бутус», которое этимологически родственно тому же глаголу «бутысить». В старину бутусом называли приземистого, плотного, коренастого человека — характеристика чисто внешняя. Но в новгородских и пермских говорах у этого слова было и другое значение: упрямец или угрюмый человек. Так что прозвище Бутыся могло указывать и на комплекцию, и на характер — или на то и другое сразу.

Сама фамилия образовалась по типичной восточнославянской модели: к основе Бутыс- добавился суффикс -ин, который в русских фамилиях указывает на принадлежность («чей?» — сын Бутыси). Первые документальные упоминания однокоренных фамилий относятся к XVII веку. Из письменных источников известен, например, устюжский дьячок Яков Бутусов (1660 год). Это говорит о том, что прозвище было в ходу на Русском Севере, и именно оттуда, вероятно, пошла и фамилия Бутысина. Так потомок человека с прозвищем Бутыся со временем получил фамилию, которая по сей день хранит память о происхождении своего рода.