Фамилия Бутысин — типичный пример русской фамилии, образованной по модели «прозвище + суффикс -ин». Суффикс -ин указывает на принадлежность: Бутысин — это «сын Бутыси» или «человек из рода Бутыси». В основе лежит прозвище Бутыся, а оно, в свою очередь, связано с глаголом «бутыскать». Этот глагол в русских говорах имел два значения: «бодать, пырять» и «бычиться, глядеть угрюмо, исподлобья». Первое значение рисует человека сварливого, склонного к драке, второе — молчаливого и мрачного.

Есть и альтернативная версия, которая не противоречит первой, а скорее дополняет её. Прозвище Бутыся могло возникнуть от слова «бутус». «Бутус» этимологически родственно тому же глаголу «бутыскать», но описывает не поведение, а внешность или характер в целом. Бутусом называли приземистого, плотного, коренастого человека. В новгородских и пермских говорах слово «бутус» означало ещё и упрямца или угрюмого человека. Получается, что прозвище Бутыся (уменьшительная форма от Бутус) могло даваться человеку за его коренастую фигуру или за упрямый, нелюдимый нрав. Оба варианта логичны и укладываются в народную традицию давать прозвища по самой заметной черте.

Первые документальные свидетельства о людях с такой же основой относятся к XVII веку. Известен, например, устюжский дьячок Яков Бутусов, упомянутый в 1660 году. Сама фамилия Бутысин, скорее всего, оформилась чуть позже, когда прозвище перешло в наследственное именование. Это типичная крестьянская или посадская фамилия: прозвища, лёгшие в её основу, редко встречались в дворянской среде, где больше ценились фамилии на -ский или от крестильных имён. Так что предки современных Бутысиных — люди простого звания, которых окружающие запомнили либо как драчунов и угрюмцев, либо как коренастых крепышей.