Фамилия Чаклина — женская форма, в основе которой лежит мужская фамилия Чаклин. Это классическая русская патронимическая модель на -ин, указывающая на принадлежность: «чей?» — Чаклин, то есть сын или потомок человека по прозвищу Чакля. Именно прозвище Чакля и есть ключ к происхождению.

Само слово «чакла» в русских говорах имело конкретное значение. В диалектах, особенно южных и западных, так называли деревянную чашку, ковш или черпак, иногда — долблёную посуду. Слово это заимствованное, восходит к тюркским языкам (ср. турецкое «çakıl» — мелкий камень, галька, но в русском закрепилось именно в значении «посудина»). Человек с прозвищем Чакля мог получить его по разным причинам: за любовь к плотницкому ремеслу (делал такие ковши), за привычку есть из большой чашки, либо же в переносном смысле — так могли прозвать коренастого, приземистого человека (по ассоциации с формой ковша).

Модель образования типична для северных и центральных областей России, где суффикс -ин был основным способом создания фамилий от основ на -а/-я. Фамилия Чаклин фиксируется в переписях и метрических книгах, в основном, в Поволжье и на Урале — регионах, где активно смешивались русские и тюркские языки, и диалектная лексика была особенно богата. Встречается и вариант с ударением на первый слог (Чаклина), и на второй (Чаклина), что характерно для фамилий с подвижным ударением.

Среди однокоренных фамилий — Чаклинский, Чаклов, но Чаклина стоит особняком: она сохранила архаичную форму прозвища, не перешедшую в более позднюю фамилию на -ов. Это указывает на то, что фамилия могла сложиться ещё в допетровскую эпоху, когда прозвища активно переходили в наследственные именования.