Фамилия Чебенова — женская форма фамилии Чебенов, и чтобы понять её происхождение, нужно разобрать мужской вариант. Основа здесь — «чебен», а суффикс «-ов» указывает на типичную русскую модель образования от прозвища или имени, оканчивающегося на твёрдый согласный. Фамилия довольно редкая, и её корни ведут в тюркские языки.

Слово «чебен» в ряде тюркских наречий (например, в казахском, башкирском, татарском) означает «муха», а в переносном смысле — «назойливый человек», «непоседа» или, наоборот, «быстрый, как муха». Прозвище Чебен могли дать человеку с живым, беспокойным характером или тому, кто постоянно находился в движении и суетился. Встречается и другая версия: в некоторых диалектах «чебен» — это «пастух» или «подпасок», особенно у народов, занимавшихся скотоводством. Тогда фамилия указывала бы на род занятий предка.

Географически фамилия Чебенов (и Чебенова) чаще всего встречается в регионах с сильным тюркским влиянием: в Оренбургской, Челябинской областях, в Башкортостане и Татарстане. Это неудивительно: русские фамилии на «-ов» нередко возникали у крещёных татар и башкир, а также у русских, живших по соседству и перенявших прозвища от местных народов.

Можно провести параллель с более известной фамилией Чебанов — она образована от того же корня, но с другим суффиксом («-ан» вместо «-ен»). Чебенов — вариант, который сохранил более точное звучание исходного тюркского слова. В написании фамилии иногда встречается путаница: через «и» (Чибенов) или с двойным «н» (Чебеннов), но исторически верной считается форма с одной «н» и буквой «е» в первом слоге.

Сословной принадлежности предков Чебеновых по одной фамилии не определить: прозвище могли носить и крестьяне, и казаки, и служилые люди. Но если исходить из значения «пастух», то скорее всего, первый носитель фамилии был человеком незнатного происхождения, занятым в скотоводстве.