Фамилия Ченегин образована по одной из самых распространённых в русской ономастике моделей — с помощью суффикса -ин, который присоединялся к основам, оканчивающимся на -а или -я. Значит, в основе лежит прозвище или мирское имя Ченега. Здесь и начинается самое интересное: корень «чен-» в русских говорах встречается редко и почти всегда связан с тюркскими заимствованиями. В диалектах Поволжья и Приуралья «ченега» — это вид крюка, багра или деревянной скобы для подвешивания чего-либо. Человек, которого прозвали Ченегой, мог быть мастером по изготовлению таких крючьев, либо, что вероятнее, его так окрестили за цепкость, хватку или невысокий, коренастый рост — «зацепистый», как багор.

Менее распространённая, но лингвистически допустимая версия выводит основу от тюркского «чен» (искренний, правдивый) или имени Ченек, которое фиксируется в татарской среде. Однако суффикс -ин в фамилиях однозначно указывает на русскую или обрусевшую среду — татары и башкиры чаще оформляли фамилии через -ов/-ев. Поэтому Ченегин — это фамилия, скорее всего, русского человека, жившего в зоне активных тюркских контактов: в Нижегородской, Симбирской, Оренбургской губерниях или в Прикамье. Прозвище Ченега попало в документы, а затем закрепилось за потомками как фамилия.

В писцовых книгах XVI–XVII веков фамилия не встречается — это говорит о её относительно позднем оформлении, возможно, уже в XVIII столетии, когда масса крестьянских и однодворческих фамилий фиксировалась при ревизиях. Крайне редкая фамилия: носители сосредоточены в Кировской области и Удмуртии, что подтверждает версию о вятском или пермском происхождении. В словаре Б. Унбегауна «Русские фамилии» Ченегин не упоминается, что типично для локальных, нераспространённых фамилий, не попавших в общерусские списки.

Если отбросить домыслы, то самый прямой ответ: предок современного Ченегина носил прозвище Ченега — либо по ремеслу (кузнец, делавший багры), либо по внешней или поведенческой черте (цепкий, хваткий человек). Фамилия не дворянская, не купеческая — скорее всего, крестьянская или мещанская, из северо-восточных русских земель.