Фамилия Чепушкин образована от прозвища или нецерковного имени Чепушка. В основе лежит диалектное слово «чепушить» — говорить вздор, болтать, пустословить. Соответственно, Чепушкой называли болтуна, пустомелю, человека, который говорит много и не по делу. Это прозвище из разряда «говорящих» — таких на Руси давали по заметной черте характера, и они легко закреплялись, если черта была яркой.

Суффикс -ин указывает на типичную восточнославянскую модель: Чепушкин — «чей?» — сын Чепушки, потомок человека с таким прозвищем. В отличие от фамилий на -ов/-ев, которые чаще образовывались от названий профессий или отчеств на -а, здесь основа — личное прозвище, а не крестильное имя. Это роднит Чепушкина с фамилиями вроде Болтунов, Пустословов, Вралёв, хотя у Чепушкина нет столь же прямого негативного оттенка — скорее ироничная бытовая характеристика.

Географически фамилия встречается в центральных и северных регионах России, особенно в Вологодской, Архангельской и Кировской областях. В этих местах слово «чепушить» было в ходу, а прозвища на -ушка — типичны для северной ономастики. Встречаются варианты написания Чепушков — с суффиксом -ов, но Чепушкин исторически первичен, так как основа оканчивается на -а.

Сословно Чепушкины относились к крестьянам или мещанам. Дворянских родов с такой фамилией не зафиксировано, что подтверждает её народное, бытовое происхождение. В дореволюционных переписях Чепушкины — это чаще всего государственные крестьяне из северных губерний.

Если сравнивать с однокоренными фамилиями — Чепурин, Чепуров, Чепухин — Чепушкин стоит особняком. У Чепурина основа «чепур» (от «чепура» — цапля или от «чепурить» — наряжаться), а у Чепушкина — именно глагол «чепушить», что делает значение прозвища более однозначным и прозрачным.