Фамилия Черкизов — это, скорее всего, не про черкесов, а про тюркское имя. Вопреки первому впечатлению, корень здесь не в названии народа, а в личном имени Черкиз (Черкез), которое в тюркских языках означает «сорок мужей» или «сорок человек» — составное из «кырк» (сорок) и «йигит» (молодец, джигит). Такие имена давали, чтобы пожелать мальчику силы и многочисленного потомства или дружины. Фамилия образована по стандартной русской модели: к основе Черкиз добавили патронимический суффикс -ов, то есть «сын Черкиза».

В русской истории эта фамилия прочно связана с конкретной местностью. Самый известный её след — подмосковное село Черкизово, которое в XIV веке получил во владение царевич Серкиз (тот же корень), выехавший из Золотой Орды на службу к Дмитрию Донскому. Его потомки, бояре Черкизовы, и дали название району, где сейчас стоит станция метро «Черкизовская». Поэтому носители фамилии с большой вероятностью имеют корни именно в центральной России, а не на Кавказе.

Менее вероятная, но допустимая версия — прозвище Черкез, данное русскому человеку за смуглую кожу или черты лица, напоминавшие о кавказских народах. В этом случае фамилия тоже закрепилась бы как Черкизов, но исходное прозвище было бы описательным, а не именным. Однако первая версия (от имени) считается основной, так как подтверждается родословными записями и ономастикой: фамилий от имени Черкиз в старых документах встречается больше, чем от прозвища.

Встречается и вариант написания с «е» — Черкезов, но Черкизов закрепился как более частый именно благодаря московскому топониму. В дворянских родословных книгах Черкизовы не числятся среди громких титулованных родов — это была фамилия служилых людей, однодворцев и крестьян, что типично для фамилий, образованных от некрестильных имён.