Фамилия Черногрядский — редкий случай, когда географическая привязка почти наверняка перевешивает прозвищную. Если разложить её на части, то корень «черно-» указывает на цвет, а «-гряд-» — на гряду, то есть на возвышенность, гребень холма или огородную грядку. Суффикс «-ский» в русских фамилиях чаще всего сигнализирует о происхождении от названия места: владельческого села или урочища. Выходит, что Черногрядский — это «тот, кто из Чёрной Гряды» или «из Чёрных Грядок».

Таких топонимов на карте России и Украины несколько. Например, в Московской области есть деревня Чёрная Грязь, но «Гряда» — не то же самое, хотя и близко по звучанию. Более вероятно, что основа фамилии связана с селом Черногрядье или Черногрядка — такие названия встречаются в чернозёмных районах. «Чёрная гряда» могла означать либо тёмный, поросший лесом холм, либо землю, выделявшуюся цветом почвы на фоне окрестностей. В ономастике эта модель хорошо известна: фамилии на «-ский» от географических названий — один из самых продуктивных способов образования дворянских и духовных фамилий в XVIII–XIX веках.

Менее вероятная, но не исключённая версия — прозвище Черногряд, которое дали огороднику, работавшему на чёрных, удобренных грядках, или человеку с тёмной кожей, прозванному «чёрным» за цвет лица. Однако в этом случае фамилия скорее приняла бы форму Черногрядов или Черногрядкин, а не «-ский». Суффикс «-ский» почти всегда привязывает носителя к месту, а не к занятию или внешности. Поэтому основная версия — выходец из населённого пункта с корнем «Черногряд-».

С точки зрения сословной истории, фамилии на «-ский» до середины XIX века были характерны для шляхты (в западнорусских землях) и для духовенства (семинаристы часто получали фамилии по названиям сёл, откуда родом). Черногрядский мог быть потомком священника или мелкопоместного дворянина. Встречаемость фамилии сегодня крайне низкая — это не массовая фамилия, а редкая, что подтверждает её локальное происхождение от конкретного, возможно, уже исчезнувшего села.