Фамилия Чернокожникова — яркий пример того, как прозвище, данное по внешности, со временем превратилось в наследственное имя. Основа здесь прозрачна: «черная кожа». Но в отличие от более распространенных фамилий вроде Чернов или Чернышев, здесь использована форма прилагательного в полном виде («чернокожий») с добавлением суффикса -ник. Именно этот суффикс и придает фамилии редкость.

Модель образования «прилагательное + -ник» в русских фамилиях встречается нечасто. Обычно так образовывали прозвища людей по характерному признаку: Белобородник, Долгорукий. В случае с Чернокожниковым исходное прозвище, скорее всего, звучало как «Чернокожник» — человек с очень темной, смуглой кожей. В крестьянской среде это могло быть не оскорблением, а нейтральным описанием: например, так могли прозвать человека, работавшего под открытым небом, или потомка от смешанных браков с южными народами.

Фамилия образована по патронимическому принципу: Чернокожников — сын Чернокожника. Женская форма Чернокожникова, соответственно, принадлежит женщине из этого рода. Суффикс -ов указывает на принадлежность, что типично для центральных и северных регионов России.

География фамилии узкая. Судя по открытым данным, Чернокожниковы встречаются преимущественно в Поволжье и на юге России, особенно в Волгоградской и Ростовской областях. Это косвенно подтверждает версию о южном происхождении прозвища: в тех краях смуглость кожи была более заметным отличительным признаком. Встречается также вариант Чернокожев, где основа та же, но суффикс другой.

В словарях фамилия не зафиксирована, что говорит о ее малой распространенности. Однако она прекрасно вписывается в ряд старых русских прозвищных фамилий, где внешность описывали прямо и без обиняков. Единственный нюанс: из-за созвучия с современным словом «чернокожий» (как расовый признак) фамилия может восприниматься как необычная или даже вызывающая, но исторически она не имела негативного оттенка — это просто меткое прозвище предка.