Фамилия Черняшкин образована по хорошо узнаваемой русской модели: суффикс -ин присоединяется к основе, оканчивающейся на -а или -я. В данном случае основа — «Черняшка». Это уменьшительно-ласкательная форма от прозвища или нецерковного имени Черняй, Черняк, которые в свою очередь восходят к прилагательному «чёрный». В древнерусской антропонимии «чёрный» — один из самых распространённых цветовых признаков: так могли назвать смуглого, темноволосого человека, либо того, кто носил чёрную одежду (например, крестьянина или монаха). Суффикс -ашк- (-яшк-) придаёт слову отчётливо ласкательный, бытовой оттенок — в документах XVI–XVII веков встречаются формы вроде Черняшко, Черняшка именно как обиходные именования простых людей.

Географически фамилия Черняшкин тяготеет к южнорусским и поволжским регионам. В переписных книгах XVII века нередки записи о крестьянах и посадских людях с корнем «черн-» — Черняевы, Черняковы, Чернышовы. Черняшкин — более редкий вариант, возникший, скорее всего, в среде, где уменьшительные прозвища были особенно живучи: в сёлах и деревнях центральной России. Встречается она и у однодворцев — особого сословия южных окраин, сочетавшего черты крестьян и мелких служилых людей.

Отдельного внимания заслуживает суффикс -ин, а не более типичный для «цветных» фамилий -ов (ср. Черняков, Чернышов). Выбор -ин указывает, что основа прозвища оканчивалась на -а: «чей сын? — Черняшкин». Это типично для прозвищных фамилий, образованных от имён с конечным -а, и лишний раз подчёркивает народное, неканоническое происхождение фамилии.

В отличие от фамилии Чернышёв, где корень «черныш» означал «чёрный как смоль» или даже «черт», Черняшкин звучит мягче, почти по-домашнему. В XX веке фамилия не получила широкого распространения и осталась сравнительно немногочисленной, что делает её носителей носителями редкого следа народной ономастики, не затронутого массовыми переименованиями. Если ваши предки — Черняшкины, они почти наверняка происходят из среды русских крестьян или однодворцев южных губерний, где ценились меткие и ласковые прозвища.