Фамилия Черой — редкий случай, когда географический след важнее лингвистического. В русском языке нет слова «черой» или «черый», поэтому искать прозвищную основу в славянской лексике бессмысленно. Скорее всего, фамилия имеет иноязычное происхождение и закрепилась в определённом регионе.

Основная версия — молдавская или румынская основа. В румынском языке «cer» означает «небо», а суффикс -oi придаёт увеличительное или пренебрежительное значение. Таким образом, «Ceroi» — «небушко», «небесный», возможно, прозвище мечтателя или человека с характерным «небесным» цветом глаз. В молдавских и румынских фамилиях окончание -ой (-oi) встречается часто: Димой, Мунтяной, Киртока. Черой — закономерная калька, где «Ч» передаёт румынское «C» перед «e».

Версия с идишем маловероятна, но не исключена. В еврейской ономастике встречается фамилия Черный (Чернин), но «Черой» могло возникнуть как вариант от ивритского корня «шар» (песня) или «цар» (горе), однако это требует натяжек. Более правдоподобно, что фамилия — результат русификации: молдавский крестьянин Черой в XIX веке попал в метрику, и окончание закрепилось.

География бытования подтверждает молдавский след. Фамилия Черой встречается в Молдавии, Приднестровье, а также на юге Одесской области Украины и на Кубани — там, куда переселялись молдавские колонисты в XVIII–XIX веках. В центральной России она практически отсутствует. Это редкая фамилия, не попавшая в массовые справочники Унбегауна или Никонова, что говорит о её локальном характере.

Что касается сословной принадлежности, то большинство носителей — потомки крестьян или мещан. Дворянских родов с такой фамилией в «Общем гербовнике» нет. Ударение, скорее всего, падает на второй слог — Черо́й, как в румынском прообразе, хотя в русской среде могли переставить на первый слог по аналогии с фамилией Чёрный.

Итог: если ваши предки — Черой, ищите корни в Бессарабии или на юго-западе Украины. Фамилия могла принадлежать молдаванину с прозвищем «небесный» или человеку, чьё имя в документах исказили до неузнаваемости. Точнее скажут только архивные записи из Кишинёва или Одессы.