Фамилия Червонкис — редкий случай, когда происхождение почти очевидно, но требует лингвистического комментария. Корень здесь — «червон-», то есть красный, червонный. В восточнославянских языках «червонный» означало «красный», «алый», а также «золотой» (червонец — золотая монета). Однако фамилия оканчивается на -кис, что сразу выдаёт её балтийское или, точнее, литовское происхождение. Формант -is (в русской передаче -ис, -кис) — типичное литовское окончание фамилий мужского рода. Таким образом, Червонкис — это литуанизированная фамилия, образованная от прозвища или прилагательного «червонный».

Скорее всего, предок носителя этой фамилии получил прозвище Червонка или Червонный за что-то красное: рыжие волосы, румянец, любовь к красной одежде, либо за то, что имел дело с червонцами (золотыми монетами) — был менялой, торговцем или ювелиром. В литовской среде такое прозвище оформили по местной грамматической модели: добавили суффикс -ис. Фамилия могла возникнуть на территории бывшего Великого княжества Литовского, где жило много славян, а литовский язык был государственным. Переселенцы или крещёные литовцы нередко получали фамилии, где славянская основа «обросла» литовским окончанием.

В отличие от типично русских фамилий на -ов или -ин, Червонкис не говорит о принадлежности отцу (чей сын). Она указывает на самого носителя прозвища. В польском языке похожая фамилия звучала бы как Czerwonka, а в литовском — Červonkis. Встречается она в основном в Литве, Беларуси и в тех регионах России, куда в XIX–XX веках переселялись литовцы или евреи из Литвы (у евреев тоже были фамилии с окончанием -ис, но чаще они образовывались от ивритских корней; здесь корень славянский). Дворянской эта фамилия не была — скорее всего, она принадлежала мещанам или крестьянам. Единственный нюанс: написание с буквой «и», а не «ы» (Червонкис, а не Червонкыс) окончательно закрепилось при русификации фамилий в паспортах советского времени. Так что главное в этой фамилии — встреча славянского корня и литовского суффикса, что сразу указывает на историческую зону контакта языков.