Фамилия Чистоходов — прозрачный пример того, как прозвище человека, данное по его привычке или образу действия, со временем превратилось в родовое имя. Её основа — чистоход, то есть тот, кто ходит чисто. В русских говорах слово «чистоход» имело два основных значения, и оба могли стать источником фамилии.

Первое и самое прямое — человек, который следит за собой и одеждой, опрятный, не терпящий грязи. В крестьянской среде, где работа в поле или в хлеву была повседневностью, такая черта выделяла человека. Второе значение — быстрый, лёгкий походкой, тот, кто ступает чисто, не поднимая пыли, не шумя. В некоторых диалектах «чистоходом» называли и ловкого, проворного человека, умеющего быстро и незаметно пройти.

Модель образования типична для русских фамилий: прозвище на -о (Чистоход) плюс патронимический суффикс -ов, означающий «сын Чистохода». Фамилия фиксируется в основном в центральных и южных регионах России, в частности в бывших Воронежской и Курской губерниях. Встречается она нечасто, что говорит о локальном бытовании прозвища.

Интересно, что фамилия Чистоходов стоит в одном ряду с однокоренными, но более редкими — Чистоход, Чистоходько, а также с фамилиями, образованными от похожих прозвищ по аккуратности: Опряткин, Чистоплюев. В отличие от последнего, «чистоход» не несёт отрицательного оттенка — это скорее нейтральная или положительная характеристика, похвала за опрятность или лёгкость в движении.

Сословная принадлежность первых носителей, скорее всего, крестьянская или мещанская. Фамилия не дворянская — в родословных книгах она не значится. Это имя человека, которого в деревне знали как опрятного, быстрого или чистоплотного, и это прозвище закрепилось за его потомками.