Фамилия Чистокол звучит как прозвище, вынесенное в паспорт, и это именно тот случай. Её основа — устойчивое выражение «чистый кол», то есть прямой, гладкий, без сучков и коры деревянный стержень. В старину «чистоколом» могли назвать человека подтянутого, опрятного, стройного или, напротив, прямолинейного до резкости, «колом» стоящего на своём.

Словообразовательная модель необычна: фамилия не получила типового суффикса (-ов, -ин), а застыла в форме чистого прозвища — так называемая «нулевая суффиксация». В русской ономастике это встречается реже, чем фамилии на -ов, и обычно указывает на позднее оформление (XVII–XVIII века) или на происхождение из среды, где фамилии складывались стихийно: среди казачества, однодворцев, крестьян северных и сибирских губерний.

Географически Чистоколы встречаются в основном в центральной России и на Урале, но ни один регион не даёт массовой концентрации — фамилия редкая. В документах XIX века её фиксируют в Вятской и Пермской губерниях, что наводит на мысль о связи с плотницким или лесным промыслом: «чистокол» — ещё и термин, которым называли отёсанное бревно для забора или частокола. Прозвище мог получить и сам мастер, делавший ровные колья, и человек, живший возле «чистого кола» — межевого знака.

Вторая, менее вероятная, версия связывает фамилию с диалектным «чистокол» — так на юге России называли вид плетня или ограды. Но здесь сложность: южные говоры обычно дают фамилии на -енко, а у Чистокола их нет. Поэтому плотницкое или характеристическое происхождение выглядит убедительнее.

В отличие от фамилий вроде Чистяков, где корень «чистый» — это часто прозвище аккуратиста, Чистокол жёстче привязан к конкретному предмету. Носитель этой фамилии мог быть не просто опрятным человеком, а тем, кого сравнивали с колом — прямым, негнущимся, может быть, даже неуступчивым.