Фамилия Чонко — редкий случай, когда географический корень почти наверняка перевешивает все остальные версии. В русском языке нет слова «чонко», а фамилия звучит как типичная украинская или южнорусская модель с уменьшительным суффиксом -к- и окончанием -о. Такие фамилии (Шевченко, Бондаренко, Ковалько) в XVI–XVII веках часто означали «сын такого-то» или «человек, связанный с чем-то». Но основа Чон- здесь неочевидна.

Самое правдоподобное объяснение — топонимическое. На Западной Украине и в Польше есть несколько мест с названием Чонко (Cząstkowo, Cząstków, а в старых записях — Чонково). Фамилия могла возникнуть, когда человека называли по месту жительства или выхода: «он из Чонкова» → «Чонко». В этом случае суффикс -ко работает как указание на принадлежность к местности, а не на отчество. Такая модель встречается у переселенцев из Подляшья, Галиции и Волыни.

Вторая версия, менее вероятная, но не исключённая — прозвище от диалектного глагола «чонкать» (стучать, цокать, издавать резкий звук). В некоторых говорах так называли человека с быстрой, отрывистой речью или того, кто работал с металлом (например, кузнеца). Однако письменных подтверждений этого слова в словарях Даля или Фасмера нет, поэтому гипотеза остаётся слабой.

Фамилия Чонко не входит в списки дворянских родов и не фиксируется в массовых переписях центральной России. Её носители встречаются в основном в Черновицкой, Хмельницкой областях Украины, а также среди потомков украинских переселенцев в Молдове и Румынии. Это говорит о том, что фамилия сформировалась в среде крестьян или мещан, а не в высших сословиях.

По суффиксу и окончанию фамилию можно спутать с польским вариантом Cząstko, который происходит от слова «cząstka» — часть, доля. В этом случае Чонко могло быть прозвищем наследника, получившего малую долю земли, или младшего сына. Но польское «ą» читается как носовое «о», и в украинской передаче оно перешло в «чон», что даёт ещё один правдоподобный путь: от польского прозвища к украинской фамилии.

Таким образом, фамилия Чонко с высокой вероятностью указывает на предка, который либо жил в местности с похожим названием, либо носил прозвище, связанное с долей или звуком. Точного ответа без генеалогического поиска не дать, но направление ясно: искать корни стоит на западе Украины и в приграничных районах Польши.