Фамилия Чухна — один из тех случаев, когда прозвище стало фамилией практически без изменений, без типичных суффиксов -ов или -ин. Это так называемая «окаменевшая» форма, что указывает на её раннее происхождение или на то, что она закрепилась в среде, где фамилии ещё не оформились по общерусскому стандарту — например, на Украине или в Белоруссии.

Корень фамилии — этноним «чухна». В дореволюционной России так называли представителей прибалтийско-финских народов (эстов, ижор, ингерманландцев). Слово происходит от древнерусского «чудь» — собирательного названия финно-угорских племён на северо-западе. Со временем «чухна» стало бытовым, не всегда нейтральным прозвищем для человека нерусского происхождения, выходца из Прибалтики или Финляндии. Однако носитель фамилии Чухна совсем не обязательно был потомком чуди: так могли дразнить и русского, который перенял какие-то черты быта или говора соседей, либо человека, жившего в «чудских» местах.

Вторая, менее очевидная версия связывает фамилию с глаголом «чухать» — в некоторых говорах это означало «чесать», «скрести», а также «понимать, соображать» (отсюда «чуха» — сообразительный человек). В этом случае прозвище Чухна могло относиться к медлительному или, наоборот, сметливому человеку. Но этническая трактовка встречается в словарях чаще и географически привязана к северо-западным губерниям — Новгородской, Псковской, Петербургской, где контакты с финно-уграми были повседневностью.

Фамилия Чухна — редкий пример прямой номинации, не замаскированной суффиксом. Она сохранила бытовое прозвище в его исходном звучании, что само по себе говорит о том, что предок носителя, скорее всего, был человеком заметным — либо по происхождению, либо по манере поведения, раз прозвище закрепилось за ним без переделки.