Фамилия Чупков образована от прозвища или нецерковного имени Чупко. В основе лежит слово «чуп» — в русских говорах так называли чуб, хохол, вихор. Чупком могли прозвать человека с непослушными, торчащими в разные стороны волосами или с заметным чубом. Модель образования типична для восточнославянских фамилий: суффикс -к- (уменьшительный или прозвищный) плюс притяжательный суффикс -ов, то есть Чупков буквально означает «сын Чупка» или «человек из рода Чупка».

Менее вероятная, но допустимая версия связывает фамилию с глаголом «чупать» (в диалектах — «щупать», «хватать»). Тогда Чупко — прозвище хваткого, ловкого человека или, напротив, того, кто любит брать чужое. Эта гипотеза слабее, так как в письменных источниках прозвища от «чуп» встречаются чаще и имеют прозрачную мотивацию.

Фамилия Чупков зафиксирована в разных регионах, но заметна её концентрация на юге России и в Поволжье. В документах XVI–XVII веков встречаются крестьяне и посадские люди с этим именем, например, в Переславле-Рязанском и в Курском крае. Среди однокоренных фамилий — Чупов, Чупахин, Чуприков, но Чупков стоит особняком: суффикс -ков здесь не от отчества (как в большинстве фамилий на -ов), а от прозвищной формы на -ко, что выдает народное, неканоническое происхождение.

Интересная деталь: в некоторых говорах слово «чупка» означало также «кисть руки» или «горсть», поэтому в отдельных случаях прозвище могло относиться к человеку с сильной или большой рукой. Однако это значение локальное и не перекрывает основную версию с чубом.

В целом фамилия Чупков — из разряда «прозрачных»: её носитель с большой вероятностью получил фамилию от предка, которого окружающие выделяли по причёске. Сословных ограничений нет: Чупковы встречались и среди крестьян, и среди мещан, и в духовенстве.