Фамилия Дандубаева — женская форма фамилии Дандубаев, которая имеет тюркские корни и встречается в основном у народов Северного Кавказа и Поволжья. Её основа — мужское имя или прозвище Дандубай, которое можно разобрать на две части: «дан» и «дубай».

Первая часть «дан» в тюркских языках (например, в кумыкском, ногайском, карачаево-балкарском) означает «слава», «известность» или «знаменитость». Вторая часть «дубай» — это вариант имени Дубай, которое в свою очередь восходит к слову «дуба» — «могила», «курган», или к глаголу со значением «насыпать», «возвышать». Таким образом, имя Дандубай могло означать «знаменитый, как курган» или «славный, возвышенный» — метафорическое прозвище, дававшееся человеку видному, уважаемому в роду.

Фамилия образована по распространённой модели: к основе Дандубай добавляется русский патронимический суффикс -ев, который адаптирует тюркское имя к русской грамматике. Встречаются также варианты написания Дандубаев/Дандубаева, реже — Дондубаева, что связано с диалектным произношением гласных.

Географически фамилия привязана к Дагестану, Чечне, Ставропольскому краю и Астраханской области. Носители — потомки кумыков, ногайцев или татар, которые в XIX — начале XX века получили фамилию по имени предка. В советское время фамилия закрепилась и у русскоязычного населения этих регионов.

Отдельного внимания заслуживает суффикс -ев: в тюркских фамилиях он встречается реже, чем -ов, и часто указывает на более позднюю русификацию, когда фамилию оформляли уже в XX веке по документам. Это делает Дандубаеву одной из тех фамилий, где тюркская основа и русский суффикс скрестились сравнительно недавно.