Фамилия Дайнатов — редкая и с неочевидной этимологией. На первый взгляд её можно принять за патроним на -ов, образованный от крестильного имени, но в святцах имени Дайнат нет. Вероятнее всего, в основе лежит прозвище или этноним.

Разберём словообразовательную модель. Суффикс -ов указывает на принадлежность: Дайнатов буквально означает «сын Дайната». Само имя или прозвище Дайнат могло возникнуть несколькими путями. Первая версия — фонетическая адаптация тюркского имени Дайнет (или Дайнат), распространённого у татар, башкир и народов Кавказа. В тюркских языках корень «дай» (дядя по матери) в сочетании с аффиксом «-нат» мог дать значение «родственник», «свой человек».

Вторая версия — связь с этнонимом «дайны». Дайны — один из монгольских родов, упоминающийся в средневековых источниках. В таком случае фамилия Дайнатов могла указывать на происхождение от человека, которого в русской среде прозвали Дайнат (от названия народа), подобно тому как появлялись фамилии Татаринов, Калмыков или Мордвинов. Эта версия правдоподобна, если учесть, что фамилия встречается в регионах с историческим присутствием тюрко-монгольских народов — например, в Астраханской, Оренбургской областях или в Забайкалье.

Третья, менее вероятная гипотеза — от греческого имени Дамиан или Дионисий через искажённую форму Дайнат. Но для этого нет прочных лингвистических оснований, и такое объяснение выглядит натяжкой.

Социальный контекст фамилии Дайнатов неоднороден. В документах XIX века носители фамилии встречаются среди государственных крестьян и однодворцев в южных губерниях, а также среди казачества. Это подтверждает версию о смешанном этническом происхождении: фамилия могла закрепиться у обрусевших татар или калмыков, перешедших в православие.

У фамилии есть редкая особенность: она почти не имеет однокоренных «собратьев» в русском ономастиконе. Нет распространённых вариантов вроде Дайнатовский или Дайнаткин — только Дайнатов и, изредка, Дайнатьев. Это говорит о локальном бытовании: фамилия не разошлась широко по стране, а осталась в нескольких конкретных родах.