Фамилия Дидушин образована от имени или прозвища, в основе которого лежит корень «Дид-». Это сокращение от имени Дмитрий. В украинском, белорусском и южнорусском говорах имя Дмитрий издавна ужимали до формы Дид, Дидусь, Дидко. Суффикс «-ушин» указывает на принадлежность: «Дидушин» буквально значит «сын или потомок Дидуши». Вместе с тем суффикс «-ин» в русских фамилиях обычно присоединяют к основам на «-а/-я», но здесь перед нами вариант, где «-ушин» мог возникнуть из формы притяжательного прилагательного от прозвища «Дидуша» или «Дидуха». То есть фамилия закрепилась за детьми человека, которого в быту звали Дидушей.

Географически фамилия тяготеет к западу России, к границе с Украиной и Белоруссией. В этих краях имя Дмитрий часто произносили с редуцированным начальным слогом — отсюда и «Дид». Встречается фамилия и у поляков в форме Diduszyn, что подтверждает её пограничное происхождение. В прошлом носители фамилии были, скорее всего, крестьянами или мещанами: фамилии с уменьшительно-ласкательным суффиксом часто давали простым людям, а не дворянам.

Есть и вторая, менее вероятная версия: основа «дид» в южных говорах означала «дед» (старик). Если прозвище Дид или Дидуша получил пожилой человек, то фамилия могла закрепиться за его внуками. Однако в таком случае логичнее ожидать форму «Дедушин» — через «е», а не через «и». Поэтому версия с именем Дмитрий выглядит убедительнее.

В написании фамилии возможны варианты: Дидушин и Дидушина (женская форма). Склоняется она по стандартному типу притяжательных прилагательных: Дидушина, Дидушину. Другие однокоренные фамилии — Дидух, Дидунов, Дидуленко — подтверждают, что корень «Дид» был продуктивным в народной ономастике.