Фамилия Докшин образована от прозвища Докша. Его происхождение связано с диалектным глаголом «докшить» — «крестить». Докшей в народной среде ласково называли крещёного ребёнка. Такая модель — отглагольное прозвище, перешедшее в фамилию, — встречается нечасто и сразу выделяет эту фамилию среди более типичных «профессиональных» или «географических» русских фамилий.

Суффикс -ин указывает на принадлежность: Докшин буквально означает «сын Докши» или «из семьи Докши». Это один из самых распространённых патронимических суффиксов в русском языке, наряду с -ов/-ев.

Существует и альтернативная версия — связь с названием белорусского города Докшицы. В этом случае прозвище Докша мог получить уроженец этих мест. Однако эта гипотеза менее убедительна: для обозначения жителя города чаще использовали суффиксы -ец или -ич (докшичанин), а прямое перенесение названия города в прозвище — явление более редкое. К тому же глагол «докшить» и его производные хорошо зафиксированы в северных и центральных русских говорах, что даёт более надёжную основу для этимологии.

Таким образом, в основе фамилии Докшин лежит не географическое название, а живое народное слово, связанное с обрядом крещения. Потомок человека, которого в семье или в деревне звали ласково Докшей, со временем получил фамилию Докшин.