Фамилия Дойникова образована от прозвища Дойник, которое восходит к глаголу «доить». Вероятно, это прозвище относится к так называемым «профессиональным» именованиям, содержащим указание на деятельность предка. Исходя из этого, можно предположить, что родоначальник Дойниковых занимался животноводством. Кроме того, в переносном смысле глагол «доить» означает «извлекать из кого-либо, чего-либо какую-либо выгоду для себя». В таком случае возможно, что основатель рода Дойниковых был хитрым, изобретательным человеком. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Дойник, со временем получил фамилию Дойникова.