Фамилия Дудоните звучит не по-русски, и это верная подсказка: перед нами литовская фамилия. Окончание -ите (в оригинале -ytė) — типичный литовский суффикс, указывающий на женский род. В Литве фамилии различаются по полу: мужчина будет Дудонис (Dudonis), а женщина — Дудоните. Поэтому носительница фамилии Дудоните — почти наверняка женщина литовского происхождения, либо её предки происходят из Литвы.

Основа фамилии — Дудон- (Dudon-). Она восходит к литовскому слову dūda, что означает «дудка», «свирель» или «труба». Это слово родственно русскому «дуда» и имеет ту же звукоподражательную природу: от звука «ду-ду». Суффикс -он- (-on-) в литовских фамилиях часто образует прозвища по роду деятельности или характерному признаку. Таким образом, Дудонис (и, соответственно, Дудоните) — это прозвище музыканта, который играл на дудке, пастуха, который пользовался дудкой для подачи сигналов, или просто человека, которого прозвали за привычку насвистывать или напевать.

В отличие от русских фамилий, где суффикс -ов/-ев указывает на принадлежность («чей сын»), литовские фамилии на -онис (-onis) и их женские формы на -оните (-onytė) часто сохраняют прямое значение прозвища. То есть предок носительницы фамилии Дудоните был, скорее всего, деревенским музыкантом или пастухом-дударем. Встречается эта фамилия в основном в Литве и среди литовской диаспоры, а в России — редко, как следствие миграций из Литвы в разные исторические периоды.