Фамилия Дуксо — редкий случай, когда иностранная основа не была русифицирована типичными славянскими суффиксами. В отличие от подавляющего большинства русских фамилий, оканчивающихся на -ов, -ин или -ский, Дуксо сохранило «голое» латинское или итальянское окончание. Это сразу указывает на позднее происхождение и, скорее всего, нерусские корни носителя.

Основа фамилии — латинское dux (в родительном падеже ducis), что означает «вождь», «предводитель». В средневековой Европе это слово дало титул «дюк» (герцог) и итальянское duca. Однако напрямую называть человека «герцогом» в крестьянской среде было бы странно. Гораздо вероятнее, что прозвище Дуксо получил человек с командирскими замашками, либо тот, кто служил у знатного лица — например, управляющий, приказчик или военный из наёмных отрядов.

В России фамилия могла появиться несколькими путями. Первый — через выходцев из Италии или южных славян (далматинцев), которых в XVIII–XIX веках приглашали на службу архитекторами, инженерами или моряками. Второй — через остзейских немцев, где фамилия Dux встречалась в среде дворянства и чиновничества. Третий, менее вероятный, — искусственное происхождение в семинарской среде: латинизированная фамилия могла быть дана ученику за успехи или как перевод прозвища «Вождь» на учёную латынь.

Словообразовательная модель здесь архаична: суффикса нет, фамилия — это чистая основа в именительном падеже, что характерно для фамилий иностранного происхождения, не адаптированных русским языком. В дореволюционных документах встречаются варианты написания Дуксъ, Дюксо, но форма на -о закрепилась, вероятно, под влиянием итальянских фамилий (ср. Дука, Дукато).

Сегодня фамилия Дуксо крайне редка. Встречается в основном на юге России и в Прибалтике, что подтверждает версию о переселенцах из Средиземноморья или немецких колонистах. Носители этой фамилии — потомки людей, чьё прозвище или чин когда-то указывали на власть, командование или службу при знатной особе, но со временем превратились в уникальный родовой знак без титульного значения.