Фамилия Дунякин отчетливо указывает на своё происхождение от имени или прозвища Дуняка. В основе лежит уменьшительно-ласкательная форма Дуня, которая в русской традиции могла быть как самостоятельным именем, так и сокращением от Евдокия (в народной форме Овдотья) или даже от Авдотья. Суффикс -ак (в форме Дуняк) в русских прозвищах часто придавал оттенок характерности: Дуняка — это человек, чем-то напоминающий Дуню, либо тот, кого так называли в кругу близких. Далее стандартный патронимический суффикс -ин превращает прозвище в фамилию, отвечающую на вопрос «чей?»: сын Дуняки.

Интересно, что в отличие от фамилий на -ов, модель на -ин в данном случае не указывает на принадлежность к духовенству или дворянству, а является типичной для северных и центральных областей России, где такие формы были особенно распространены среди крестьян и посадских людей. Дунякин — фамилия редкая, её носители чаще всего встречаются в Поволжье и на Урале, что подтверждается данными переписей XIX века. Встречаются и варианты написания — Дунякин, реже Дуняков, что может говорить о диалектных колебаниях в произношении.

Споров о корне фамилии практически нет: версия с именем Евдокия/Авдотья — единственная убедительная. Альтернативные гипотезы (например, связь с диалектным словом «дуня» в значении «глупец» или «простофиля» в некоторых говорах) существуют, но слабо подтверждены и не меняют сути: в любом случае прозвище было образовано от личного имени или бытовой характеристики. По социальному происхождению Дунякины — скорее всего, крестьяне или мещане, поскольку фамилии на -ин от прозвищ на -ак в дворянской среде почти не встречались.