Фамилия Дыненберг — классический пример фамилии немецкого или ашкеназского происхождения, образованной по топонимическому принципу. В её основе лежит немецкое слово «Düne» (дюна) и «Berg» (гора, холм). Буквально Дыненберг можно перевести как «дюнная гора» или «холм среди дюн». Скорее всего, так называлось конкретное поселение, хутор или географический объект на землях, где говорили по-немецки — в Пруссии, Силезии или Прибалтике.

Тип фамилии — «берговская» (Berg), одна из самых распространённых моделей в немецкой ономастике. Такие фамилии давали человеку, который жил рядом с горой, холмом или замком на возвышенности. В данном случае географический признак уточнён: не просто гора, а именно дюна. Это указывает на прибрежную или песчаную местность, например, на побережье Балтийского моря. В отличие от чисто славянских фамилий, у Дыненберг нет суффикса принадлежности (-ов, -ин, -ский), что сразу выдаёт её западное происхождение.

Вероятнее всего, предок носителя фамилии получил её по месту жительства — из деревни или поместья Дыненберг. Такие названия встречаются в исторических землях Восточной Пруссии (современная Калининградская область и северо-восток Польши). Фамилия могла быть записана как Dünenberg, а при переходе в русскую среду «ü» передали через «ы», что дало современное «Дыненберг». Это типичный случай адаптации немецкой фонетики под кириллицу.

Вторая, менее вероятная версия, связывает фамилию с еврейским ашкеназским ономастиконом. В этом случае «Дыненберг» могло быть искусственно составленным именем, где вторая часть «-берг» означала «гора», а первая — искажённое «дин» (суд, закон на иврите). Однако такая этимология спекулятивна: для ашкеназских фамилий характерны сочетания вроде «Розенберг» или «Гольдберг», а «Дыненберг» — редкий вариант. Правдоподобнее всё же считать её чисто немецкой топонимической фамилией, без религиозного подтекста.

В России фамилия встречается нечасто и, как правило, у потомков немецких колонистов или еврейских семей, переселившихся из Прибалтики и западных губерний в XIX веке. Поскольку фамилия не была массовой, носители могли быть как ремесленниками и торговцами, так и людьми интеллигентных профессий — врачами, юристами. Точных данных о сословной принадлежности нет, но сам тип фамилии (без дворянской приставки «фон») указывает на бюргерское или мещанское происхождение.