Фамилия Джаксалыков — редкий пример тюркской фамилии, которая почти не претерпела изменений при переходе в русскую среду. Её основа — личное имя Джаксалык, которое состоит из двух корней: «джакса» (в разных тюркских диалектах — «хороший», «добрый», «благой») и «лык» (суффикс, образующий отвлечённое понятие или качество). Вместе имя можно перевести как «благодетель», «добрый человек» или «тот, кто несёт благо». Фамилию образовали по стандартной русской модели: к основе Джаксалык добавили патронимический суффикс -ов, означающий «сын такого-то». Таким образом, Джаксалыков — буквально «сын Джаксалыка».

Написание фамилии выдаёт её казахские или каракалпакские корни. В казахском языке слово «жақсылық» (жақсы — хороший, -лық — суффикс) означает «добро», «благо», «хорошее дело». В русской записи начальный звук «ж» часто передавали как «дж» — это типично для дореволюционных и раннесоветских документов, где не было устоявшейся транскрипции. Фамилия могла закрепиться в форме Джаксалыков именно из-за особенностей записи в метрических книгах или при переписях населения.

Интересно, что суффикс -ов в этой фамилии — не тюркский, а чисто русский. В родной среде у казахов или каракалпаков такое имя не стало бы фамилией в современном понимании: его использовали бы как отчество (Джаксалыкулы — «сын Джаксалыка») или вовсе не зафиксировали бы в письменной форме. Появление фамилии на -ов говорит о том, что носители жили в зоне активного русского административного влияния — скорее всего, в северных или центральных областях Казахстана, в Оренбургской губернии или в Поволжье, где тюркское население массово получало фамилии в XIX — начале XX века.

Сословная принадлежность предков Джаксалыковых, скорее всего, была крестьянской или казачьей. Среди казахов и каракалпаков фамилии на -ов чаще всего получали те, кто служил в казачьих войсках, занимался торговлей или переходил к оседлому образу жизни. Имя Джаксалык могло быть дано ребёнку как пожелательное — чтобы он вырос добрым и приносил пользу людям.

Других версий происхождения у этой фамилии нет: она слишком прозрачна по составу, чтобы искать в ней монгольские или иранские корни. Встречаются варианты написания Джаксалыков и Джаксалык — второй вариант мог быть исходной формой имени, которая позже обросла суффиксом. Сейчас фамилия остаётся очень редкой, и её носители живут в основном в Казахстане и в приграничных регионах России.