Фамилия Джубалиева — одна из тех, чью историю нужно начинать с мужского личного имени. В её основе лежит восточное имя Джубали, которое, в свою очередь, складывается из двух тюркских корней. Первый — «джуб», что переводится как «преследуемый». Второй — «али», сокращённая форма имени Аллах, означающего «возвышенный». Получается, что имя Джубали несло значение «преследуемый Аллахом». В контексте исламской традиции это не негативный оттенок, а скорее указание на человека, которого ведёт или испытывает высшая сила.

Фамилия образована по распространённой для тюркских и кавказских народов модели: к основе имени добавляется суффикс -ев/-ова, указывающий на принадлежность к роду. Джубалиева — это буквально «дочь или жена Джубали», а в родовом смысле — «из рода Джубалиевых». Такие фамилии чаще всего фиксировались у народов, исторически исповедовавших ислам и живших на стыке тюркского и персидского культурных влияний.

Стоит отметить, что имя Джубали встречается не повсеместно: оно характерно для определённых регионов, в частности для Дагестана, где подобные антропонимы с корнем «джуб» (иногда в варианте «чуб») и теофорным элементом «али» не редкость. Это позволяет предположить, что предки носителей фамилии Джубалиева могли быть выходцами из горных районов Северного Кавказа.

Процесс становления фамилий у народов Востока был долгим и неравномерным. В отличие от русских фамилий, которые в основной массе сложились к XVII–XVIII векам, у тюркских и кавказских народов фамилии в современном понимании закрепились лишь в XIX–XX веках, часто — после административных реформ Российской империи. Поэтому точное время возникновения рода Джубалиевых можно установить только через генеалогические изыскания, изучая списки сельских общин, метрические книги или советские паспортные записи.

Любопытна и словообразовательная параллель: фамилия Джубалиева стоит в одном ряду с такими, как Алиев, Джумалиев, Джуберов. Все они используют похожую модель — сочетание личного имени с суффиксом принадлежности. Разница лишь в корне: у Джубалиева он более редкий и узкорегиональный, что делает фамилию менее распространённой, но более характерной для конкретной этнической среды.