Фамилия Единархова — редкая и нестандартная для русского уха. Её основа сразу привлекает внимание: в ней слышится что-то книжное, церковное или даже греческое. И это неслучайно. Скорее всего, в основе фамилии лежит слово «единарх» — понятие из церковной иерархии. Единархом (от греческого «монарх» в значении «единовластный правитель») в православной традиции могли называть настоятеля крупного монастыря или главу самостоятельной церковной области. Однако в бытовом, неперковном обиходе это слово не употребляли — оно было термином узких кругов.

Отсюда и главная версия происхождения: фамилию дали не крестьянину и не ремесленнику, а человеку, связанному с духовным сословием. Сын или внук единарха (церковного начальника) мог получить прозвище Единарх, а затем и фамилию Единархов. Суффикс -ов в данном случае указывает на принадлежность: «чей?» — Единархов, то есть потомок того, кого звали Единархом. Модель образования типична для русских фамилий из духовной среды (сравните: Митрополитов, Патриархов, Архипов), но само слово встречается настолько редко, что фамилия осталась штучной.

Есть и менее вероятная, но допустимая версия: фамилия могла возникнуть как искусственная, семинарская. В XVIII–XIX веках в духовных училищах ученикам нередко меняли «неблагозвучные» бытовые фамилии на грецизированные или латинизированные. Единархов — как раз из таких: звучит возвышенно, намекает на власть и порядок. Однако в этом случае фамилия была бы более распространённой, а она, судя по данным переписей, остаётся локальной и малочисленной.

Географически фамилия Единархова встречается в основном в центральных и северных регионах России — там, где были сильны монастырские традиции и где фамилии духовенства дольше сохраняли архаичные формы. Встречается она и в женском варианте (Единархова), что говорит о том, что род не прервался и дожил до наших дней.

Таким образом, Единархова — это фамилия-указатель на церковное прошлое предка. Её носители, скорее всего, потомки людей, имевших отношение к управлению монастырём или церковной областью, либо выходцы из семинарской среды, получившие «учёное» прозвище. В любом случае, фамилия эта — редкий свидетель дореволюционной церковной иерархии, сохранившийся в нескольких семьях.