Фамилия Ефаненков образована от имени собственного и относится к распространенному типу славянских фамилий. Основой фамилии Ефаненков послужило церковное имя Епифан. Имя Ефан представляет собой просторечную форму канонического мужского имени Епифан. Это имя образовано от греческого epifanes и переводится как «видный, известный, знатный». Однако на Руси это имя всегда считалось простонародным. Существовала поговорка о бедняке: «Рад Епифан, что нажил серый кафтан». Суффикс -енко указывает на то, что фамилия Ефаненков возникла под украинским влиянием. Фактически фамилия Ефаненков представляет собой отчество второго порядка: Ефаненков — сын Ефаненко и внук Ефана. Таким образом, потомок человека, обладающего именем Ефан, со временем получил фамилию Ефаненков. О точном месте и времени возникновения фамилии Ефаненков в настоящее время говорить сложно, поскольку процесс формирования фамилий был достаточно длительным. Тем не менее, фамилия Ефаненков представляет собой замечательный памятник славянской письменности и культуры.