По одной из версий, фамилия Эккер образована от немецкого мужского имени Эккер (Эккерт). Оно состоит из двух слов германского происхождения: agi - «лезвие, острие» и hard - «твердый, сильный». Согласно другой гипотезе, в основе этой фамилии лежит прозвище Эккер, образованное от верхненемецкого слова ecke - «угол» при помощи суффикса -ер. Возможно, так называли человека, который жил на углу улицы или того, кто был хозяином магазина, находившегося на углу дома. Возможно, прозвище Эккер имеет еврейские корни и восходит к идишскому слову eker - «мясник, резник», «дровосек», «тот, кто рубит, режет». В этом случае оно относилось к числу «профессиональных» именований и указывало на род занятий человека. Наконец, не исключено, что фамилия Эккер ведет свое начало от немецкого слова Ecker, которое в переводе на русский язык означает «желудь, буковый орешек».