Фамилия Екомасов — редкий пример, где за привычным русским окончанием скрывается нерусская, скорее всего мордовская, основа. Её варианты — Екамасов, Якомасов, Икамасов — указывают на неустойчивость первого гласного в живой речи, что типично для заимствованных слов.

Основная версия происхождения ведёт к древнему мордовскому слову «екамас». Исследователи, в частности А. Покорный, возводят его к индоевропейскому корню *ekuos-, что значит «лошадь». Если это так, то прозвище Екомас мог получить табунщик — человек, работающий с лошадьми. Мордовские языки (эрзянский и мокшанский) сохранили немало слов с этим корнем, и фамилия могла закрепиться за целым родом конных пастухов или коневодов.

Есть и вторая гипотеза — татарская. Здесь фамилию разбивают на две части: eki («два») и масаю («гордиться»). В буквальном переводе Екомасов означает «вдвойне гордый». Такое прозвище могли дать человеку важному, уважаемому либо многодетному отцу — в традиционных обществах статус часто подчёркивался именно так. Обе версии имеют право на существование: география фамилии (Поволжье, Урал) допускает как мордовские, так и татарские корни.

Совершенно ошибочно связывать фамилию с эсперанто — искусственным языком, созданным в 1887 году варшавским окулистом Лазарем Заменгофом. Слово ekamas на эсперанто означает «быть влюблённым», но сама фамилия возникла задолго до появления этого языка, так что совпадение случайно.

По суффиксу фамилия — типичная русская патронимическая модель: -ов добавляли к основе, чтобы обозначить «сына Екомаса» или «потомка Екомаса». Со временем окончание закрепилось, и фамилия обрусела, хотя корень остался иноязычным.