Фамилия Екжанов — редкий случай, когда разбор стоит начать не с корня, а с суффикса. Окончание -ов указывает на классическую русскую патронимическую модель: «чей?» — «Екжанов», то есть сын Екжана. Но само имя Екжан — не русское и не церковное. Это составное тюркское имя, распространённое у башкир, татар, казахов: «Ек» (вариант «Ик», «Еге») — «господин, хозяин» или «двойня» (в разных диалектах), плюс «жан» — «душа». Буквально — «господская душа» или «дорогой, как душа». Скорее всего, предок носителя фамилии был крещёным татарином или башкиром, получившим при крещении мирское имя Екжан, которое и закрепилось в роду.

География фамилии подтверждает эту версию. Екжановы встречаются в Оренбургской области, Башкортостане, Татарстане — то есть в зоне активного контакта русского и тюркского населения. В метрических книгах XIX века фамилия фиксируется среди государственных крестьян и казаков, что говорит о непривилегированном происхождении. Никаких дворянских родов Екжановых не известно — это фамилия простых людей, возможно, казаков-земледельцев или мелких торговцев.

Словообразовательная цепочка проста: тюркское личное имя Екжан → русский патроним Екжанов (сын Екжана) → закрепление в качестве фамилии. Суффикс -ов здесь типичен для фамилий, образованных от основ на твёрдый согласный. Если бы имя оканчивалось на -а, мы бы получили форму Екжанин, но этого не произошло.

Есть и более редкая версия, которую приводят некоторые ономасты: связь с диалектным словом «екжать» — «говорить с придыханием, окать». Тогда Екжан — прозвище человека с характерной манерой речи. Однако эта гипотеза слабее: прозвищная форма «Екжа» (от глагола) дала бы фамилию Екжин или Екжов, а не Екжанов. Тюркское имя объясняет и суффикс, и географию убедительнее.

Фамилия нечастотная: по данным переписей XXI века, в России живёт не более нескольких сотен носителей. Основная масса сосредоточена в Поволжье и на Южном Урале.