Фамилия Елунцов — редкий случай, когда географическая привязка почти наверняка перевешивает все прочие версии. В основе лежит топоним, а не личное имя или ремесло, и это главное, что стоит знать.

Носители фамилии исторически сосредоточены на Русском Севере, в первую очередь в Архангельской области и бывшей Вологодской губернии. Там есть река Елунга (Елунга) — приток Северной Двины. Жителя с ее берегов могли прозвать «елунцом» по той же модели, что «архангелогородец» — по названию местности. Суффикс -ец в русских фамилиях указывает на выходца с определенной территории. Позже к этому прозвищу добавился стандартный патронимический суффикс -ов, и получилось «Елунцов» — буквально «сын того, кто с Елунги».

Менее вероятная, но допустимая версия отталкивается от диалектного глагола «елундить» — в северных говорах это значит «шататься без дела», «плутать». Тогда прозвище Елунец мог получить человек непоседливый или тот, кто часто блуждал по лесу. Однако против этой гипотезы говорит редкость глагола и отсутствие широкого ряда аналогичных прозвищ на -ун-: обычно такие основы дают фамилии вроде Болтунов или Ворчунов, где корень прозрачен. «Елун» без дополнительных следов в языке выглядит искусственным.

С точки зрения словообразования фамилия стоит особняком. Суффикс -цов в русских фамилиях встречается в два-три раза реже, чем -ов, и почти всегда указывает на промежуточную ступень: прозвище на -ец → фамилия на -ов. Это делает Елунцова не просто «сыном Елуна», а «сыном того, кого звали Елунец». Такая двойная суффиксация — верный признак того, что фамилия сложилась не в центральных уездах, а на периферии, где дольше сохранялись прозвищные формы.

В дореволюционных переписях Елунцовы встречаются почти исключительно среди государственных крестьян и мещан. Дворянских родов с такой фамилией не зафиксировано. Сегодня она остается редкой: по приблизительным подсчетам, в России насчитывается не больше нескольких сотен носителей, и основная их часть по-прежнему живет в Архангельской области и соседних регионах.