Фамилия Елышкина — женская форма, а её мужской вариант Елышкин. В основе лежит прозвище или нецерковное имя, а точнее — корень «елыш-», который напрямую связан с деревом. Ель — одно из самых распространённых деревьев в средней полосе России, и производные от него прозвища давали людям по разным причинам. Елышкой могли назвать человека высокого, худого или «колючего» по характеру, либо того, кто жил в еловом лесу или занимался заготовкой еловой древесины.

Словообразовательная модель здесь простая и прозрачная. Суффикс «-ин» указывает на принадлежность: Елышкин — это «сын Елышки» или «человек из рода Елышки». В русской ономастике такие фамилии на «-ин» типичны для северных и центральных областей России, где широко бытовали прозвищные формы от названий деревьев. В отличие от фамилий на «-ов», которые чаще образовывались от полных крестильных имён, «-ин» закрепился за основами, оканчивающимися на согласный или мягкий знак.

Стоит обратить внимание на редкий суффикс «-ышк-» в основе. Это уменьшительно-ласкательный формант, характерный для русских народных говоров. Он придаёт прозвищу оттенок не столько пренебрежения, сколько бытовой фамильярности: Елышка — это не просто «ель», а «ёлочка» или «еловый человечек». Такие формы часто встречались в крестьянской среде, где прозвища были живыми и образными. Таким образом, Елышкины — потомки человека, которого в деревне звали ласково или иронично Елышкой.

Если рассматривать альтернативные версии, то иногда корень «елыш-» связывают с диалектным глаголом «елызгать» (ходить без дела, слоняться) — в некоторых говорах так называли непоседливого человека. Но эта гипотеза слабее: во-первых, глагол редкий и локальный, во-вторых, связь с «елью» для русского уха гораздо естественнее и подтверждается массой однокоренных фамилий (Елькин, Ельцов, Ельников). Поэтому основная версия — «от дерева ель» — остаётся наиболее правдоподобной.

Географически фамилия Елышкин встречается преимущественно в Поволжье и на севере европейской части России — в Кировской, Нижегородской, Вологодской областях. Это косвенно подтверждает «лесное» происхождение: именно в этих регионах еловые леса — часть традиционного ландшафта. Сословно предки Елышкиных, скорее всего, были крестьянами или лесными промысловиками, поскольку фамилии от прозвищ на «-ышк-» редко встречались в дворянской среде.