Фамилия Емакова — женская форма от Емаков. В основе лежит мужское имя или прозвище Емак. Это уменьшительная форма от крестильного имени Емельян (в просторечии — Ема, Емка). Емельян в переводе с греческого означает «льстивый», «ласковый», но в русской традиции имя связывали скорее с трудолюбивым и основательным характером, без особого налёта лести. Так что первый и самый очевидный вариант: предок носителя фамилии — Емельян, которого в быту звали Емаком.

Но есть и вторая версия, не связанная с церковным именем. В некоторых говорах, особенно на Русском Севере, «ема» или «ёмка» означало «еда», «корм», «приём пищи». Отсюда прозвище Емак могли дать человеку с хорошим аппетитом, любящему поесть, или, наоборот, тому, кто кормил других — например, хлебосольному хозяину. Такое прозвище фиксируется в документах XVII века, что делает эту гипотезу вполне реальной.

Модель образования типична для русских фамилий: суффикс -ов/-ев присоединялся к основе, указывая на принадлежность («чей?» — сын Емака). Поэтому Емаковы — это потомки человека по имени или прозвищу Емак. Фамилия не дворянская и не купеческая, а крестьянская или мещанская, что подтверждается её распространением в среде бывших государственных крестьян.

Географически фамилия Емаковы чаще всего встречается в Поволжье и на Урале, особенно в Пермском крае и Кировской области. Там же зафиксированы и однокоренные фамилии: Емашев, Еманов, Емакин. Встречается и вариант написания с буквой «ё» — Ёмаков, что в дореволюционных документах могло путаться, так как «ё» не всегда ставили.

Если говорить о редкой детали: в некоторых переписях XIX века фамилию записывали как «Ямаков» — из-за акающего произношения (Емак звучало как «ямак»). Это может сбить с толку при поиске предков по архивам, но корень остаётся тем же — либо от Емельяна, либо от прозвища, связанного с едой.