Фамилия Эмеева — женская форма, мужской вариант — Эмеев. В основе этой фамилии, скорее всего, лежит тюркское личное имя или прозвище Эме. В тюркских языках слово «эме» имеет несколько значений: «бабушка», «мать», «кормилица», а также может означать «лекарство» или «целительница». Вряд ли фамилию дали напрямую от «бабушки» — скорее, это было прозвище уважаемой, мудрой женщины или же человека, занимавшегося врачеванием.

Суффикс -ев (а не -ов) указывает на то, что основа оканчивалась на мягкий согласный или гласный. В данном случае это типичная модель для фамилий, образованных от тюркских имен с конечным -е: Эме → Эмеев. Фамилия распространена в регионах с тюркским населением — среди татар, башкир, чувашей, а также у народов Кавказа (кумыков, ногайцев). В русских документах XIX века такие фамилии нередко фиксировались у крещёных татар или служилых людей из тюркской среды.

Есть и другая, менее вероятная версия: связь с арабским именем Имам (через диалектное произношение). Но для этого пришлось бы допустить сильное искажение, тогда как прозвище Эме встречается в тюркской ономастике напрямую. Спорных гипотез больше нет — корень ясен.

География фамилии сегодня сосредоточена в Поволжье и на Северном Кавказе. Встречается она нечасто, что говорит о её локальном происхождении: возможно, предок был известен в одном селе или роде как Эме (целитель или уважаемая женщина), и это прозвище закрепилось за потомками. Сословная принадлежность носителей в прошлом могла быть разной — от крестьян до духовенства, но точных данных по конкретным семьям нет.