Фамилия Емелюшкин образована от производной формы церковного мужского имени Емельян - Емелюшка. Это имя переводится с греческого как «льстивый» (по другой версии, от латинского «соперник, участник соревнований»). Таким образом, потомок человека, обладающего именем Емелюшка, со временем получил фамилию Емелюшкин.