Фамилия Ендеркин происходит от древнейшей формы славянских фамильных прозвищ, образованных от географического названия местности, выходцем из которой являлся один из предков. Фамилия Ендеркин происходит от названия ручья Индерка (вариант названия – Ендерка) – левый приток Суры. На нем расположено татарское село Сосновоборского района. Жители объясняют гидроним и название села от татарского слова «ендыр» – «гумно». Однако не исключено также, что гидроним ведет свое начало от названия села Индырчи в Чувашии и с чувашским мужским именем Инедер, дополненным русским суффиксом -ка. Скорее всего, что основатель рода Ендеркиных был уроженцем этих мест. Фамилии, образованные от географических названий, были широко распространены и в других сословиях. Поскольку фамилии такого типа содержали указание не только на принадлежность к конкретной семье, но и на отношение к определенному географическому объекту, то изначально они представляли собой прилагательные с различными формантами: фамилии на – ский /-цкий и –анинов /-янинов принадлежат в основном знати и дворянству; фамилии на –итов /-ичев, -инов, -цев, - яков /-аков, - ников, -ин, -их /-ых - представителям всех остальных сословий. О точном месте и времени возникновения фамилии Ендеркин в настоящее время говорить сложно, поскольку процесс формирования фамилий был достаточно длительным. Тем не менее, фамилия Ендеркин представляет собой замечательный памятник славянской письменности и культуры.