Фамилия Епаков, скорее всего, восходит к производной форме крестильного мужского имени Епифан — Епак. Оно, в свою очередь. восходит к греческому слову epifanes, что переводится как «видный, известный, знатный» или «Богом явленный». Согласно другой гипотезе, фамилия Епаков ведет свое начало от названия реки Епака, протекающей в Байкитском районе Эвенкийского автономного округа. Сам гидроним образован от эвенкийского слова «япака» - «рыхлый берег реки, глубокий сырой снег». Исходя из этого, можно предположить, что основатель рода Епаковых родился и жил на берегу этой реки. Таким образом, потомок человека, обладающего именем Епак, со временем получил фамилию Епаков.