Фамилия Ермуканов образована по самой распространённой в русском языке модели: к основе добавили суффикс -ов, который указывает на принадлежность («чей?» — сын Ермукана). Значит, в основе лежит личное имя или прозвище Ермукан. Разберёмся, что это за имя.

Ермукан — это сложносоставное тюркское имя. Первая часть, Ер-, восходит к слову «ер» (мужчина, герой, воин). Вторая часть, -мукан, скорее всего, вариант имени Мукан или Мухан, которое в свою очередь может быть производным от арабского имени Мухаммад (прославленный, достохвальный). Таким образом, имя Ермукан можно истолковать как «герой Мухаммад» или «мужчина, подобный Мухаммаду». Имена с компонентом «ер» были популярны у многих тюркских народов, особенно у казахов, башкир, татар, где ценились воинские доблести.

Вероятнее всего, фамилия Ермуканов имеет казахское происхождение. В казахском ономастиконе имя Ермукан встречается, и от него закономерно образована фамилия с русским суффиксом -ов, что типично для документов Российской империи и советского периода. Фамилия фиксируется преимущественно в Казахстане и в прилегающих регионах России (Оренбургская, Астраханская области).

Менее вероятная, но возможная версия: основа Ермук- может быть связана с диалектным вариантом слова «ермолка» (шапка) или с названием реки Ермак. Но в таком случае фамилия звучала бы как Ермуков, а не Ермуканов. Суффикс -ан в основе указывает именно на имя, которое давали ребёнку. Предок носителя фамилии, Ермукан, скорее всего, был человеком, получившим имя в честь героического предка или с пожеланием стать мужественным и достойным человеком.